本系原為「化學工程學系」，成立於1971年，1992年增設「化學工程研究所」，招收碩士班研究生，從2001年開始招收博士班研究生。2003年時為了配合產業發展及社會脈動，更名為「化學工程與材料工程學系」，並致力課程結構之調整及新課程之規劃，畢業系友迄今已超過7,000人，深植於產業界及學術界。為因應少子化現象，自2015年（104學年度）起，大學部減招1班，由原來的3班調整為2班(每班60人)以維持學生素質。本系2007年已通過「中華工程教育學會(IEET)」之工程教育認證，維持畢業生具備工程及科技教育高品質，並與國際接軌。